模拟增温下短花针茅实时荧光定量内参基因的筛选及验证

编号 zgly0001563768

文献类型 期刊论文

文献题名 模拟增温下短花针茅实时荧光定量内参基因的筛选及验证

作者 高金玉  郭慧琴  曹路  韩冰 

作者单位 内蒙古农业大学生命科学学院  中国农业科学院草原研究所 

母体文献 草地学报 

年卷期 2017年05期

年份 2017 

分类号 S54 

关键词 模拟增温  短花针茅  实时荧光定量PCR  内参基因 

文摘内容 本研究以荒漠草原植物短花针茅(Stipa breviflora)为材料,在模拟增温处理下,通过q RT-PCR试验分析9个候选内参基因的表达稳定性,运用Delta-CT法,ge Norm,norm Finder,Bestkeeper软件及Ref Finder在线工具进行候选内参基因的稳定性分析。经普通PCR剔除3个内参基因后,6个候选内参基因表达稳定性由高到低排序为:TLF,18 s r RNA,APRT,TUBα,EF-1α,Actin2。以TLF作为内参基因,在模拟增温下短花针茅转录组数据库中随机选择5个基因进行验证。q RT-PCR结果表明,5个验证基因在增温与对照之间的相对表达量存在倍率变化,且与转录组测序中的变化趋势一致,从而确定TLF为短花针茅增温处理下的最佳内参基因。