菠菜雌雄同株性状的全基因组关联分析

编号 zgly0001677807

文献类型 期刊论文

文献题名 菠菜雌雄同株性状的全基因组关联分析

作者 汪豪英  刘志远  王晓武  武剑  张合龙  夏志兰  徐兆生  钱伟 

作者单位 湖南农业大学园艺园林学院  中国农业科学院蔬菜花卉研究所 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2019年08期

年份 2019 

分类号 S636.1 

关键词 菠菜  全基因组  关联分析  雌雄同株 

文摘内容 菠菜为典型的雌雄异株植物,少数植株表现为雌雄同株。为了挖掘控制菠菜雌雄同株的基因位点,对82份菠菜高代自交系的性型进行调查分析,同时进行测序深度为10×的重测序。重测序共获得了3 420 496个SNP,过滤后得到1 621 970个多态性高的SNP位点。利用高质量的SNP对菠菜雌雄同株的性状进行了全基因组关联分析(GWAS)。利用压缩混合线性模型(compress mixed linear model,cMLM)在菠菜4号染色体上检测到1个强关联区域。基于强关联信号SNP位点LD值(31.2kb)的大小,将控制菠菜雌雄同株的基因X~m定位在64.6kb的区间内。该范围内存在3个基因:Spo24600、Spo24601和Spo24602。该研究在关联区域内开发了KASP标记,可以有效用于菠菜雌雄同株的鉴定。