分子标记法和形态学特征对杏仁栽培种及野生种基因型的遗传关系构建的辨别

编号 zgly0001352280

文献类型 期刊论文

文献题名 分子标记法和形态学特征对杏仁栽培种及野生种基因型的遗传关系构建的辨别

作者 Karim Sorkheh  Behrouz Shiran  Soghra Kiani  Nazanin Amirbakhtiar  Sadegh Mousavi  Vahid Rouhi  Shahram Mohammady-D  Thomas M.Gradziel  Lyudmyla V.Malysheva-Otto  Pedro Martínez-Gómez 

作者单位 Department of Agronomy and Plant Breeding  Faculty of Agriculture  Shahrekord University  Scientific assistance of Payam-e-Nour University  Department of Plant Science  University of California  Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK)  D 

母体文献 Journal of Forestry Research 

年卷期 2009年03期

年份 2009 

分类号 S662.2 

关键词 扩增片段长度多态性  随机扩增多态DNA  简单序列重复  种质  遗传关系  杏仁 

文摘内容 应用23个形态学特征,19个扩增片段长度多态性(AFLP)引物组合,80个随机扩增多态DNA (RAPD)引物和32个简单序列重复(SSR)引物对,比较三种分子标记法在29个杏仁栽培种和3个野生种遗传关系构建中的信息量和效率。根据预期杂合度的评价,与AFLPs和RAPDs相比,SSRs具有较高水平的多态性和较大的信息量。AFLPs预期杂合度值最低,但其辨别效率值最高,因为AFLPs能揭示每个反应中的大量条带,导致各种类型的多样性指数均较高。三种分子标记法对杏仁基因型的辨别效率均较高,只是SSRs无法辨别‘Monagha’和‘Sefied’杏仁基因型。三种分子标记法基因型相似性相关系数统计上显著,但SSR数据要低于RAPDs和AFLPs的值。尽管三种分子标记法树形图拓扑结构存在一些差异,但相似性水平均较高。SSRs、 RAPDs和AFLPs的系统树图及其综合数据都能依据地理散布反映大多数栽培种的关系。AMOVA检测到每个地理组中栽培种和野生种的变异。辅助程序分析表明,实验所应用的标记物数量足以保证基因相似性估计的可靠性和标记法间的比较是有意义的。