利用iPBS技术克隆牡丹反转录转座子LTR序列

编号 zgly0000901946

文献类型 期刊论文

文献题名 利用iPBS技术克隆牡丹反转录转座子LTR序列

学科分类 220.1070;森林植物学

作者 张曦  侯小改  郭大龙  宋程威  段亚宾 

作者单位 河南科技大学农学院  河南省高校牡丹工程技术中心  河南科技大学林学院 

母体文献 植物学报 

年卷期 2014(3)

页码 322-330

年份 2014 

关键词 iPBS  LTR类反转录转座子  序列分析  SSAP分子标记 

文摘内容 利用iPBS方法从西北牡丹(Paeonia suffruticosa)品种红绣球和中原牡丹品种洛阳红中扩增出相应片段,经回收、克隆及测序,获得了12条来自牡丹LTR类反转录转座子的LTR序列,并用相关生物信息学软件对序列进行分析。结果表明,这些核苷酸序列表现出较高的异质性,主要表现为缺失突变,序列长度变化范围为313–894 bp,同源性从31.1%–65.8%不等。将其氨基酸序列与已登录的不同植物LTR类反转录转座子LTR氨基酸序列进行聚类分析,结果显示与某些植物相应序列具有较高的同源性,表明可能存在LTR类反转录转座子的横向传递关系。