苹果UV-B受体基因UVR8的克隆及生物信息学分析

编号 zgly0001496243

文献类型 期刊论文

文献题名 苹果UV-B受体基因UVR8的克隆及生物信息学分析

作者 丁文展  张高龙  樊连梅  刘更森  隋秀奇  原永兵 

作者单位 青岛农业大学园艺学院青岛市现代农业质量与安全工程重点实验室  烟台现代果业科学研究所 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2015年08期

年份 2015 

分类号 S661.1  Q943.2 

关键词 ‘富士’苹果  UV-B受体  Md UVR8  同源克隆  生物信息学分析 

文摘内容 本研究以‘富士’苹果红色芽变品种‘烟富8’果皮为试验材料,采用RT-PCR方法,克隆获得苹果UV-B受体基因UVR8的全长序列,命名为Md UVR8。结果显示,开放阅读框长度为1 359 bp,编码452个氨基酸,相对分子质量48.487 k D,等电点(PI)为5.56。蛋白质保守域分析表明,苹果UVR8蛋白包含7个RCC1结构域。蛋白质二级结构预测显示,苹果UVR8蛋白含有10个琢-螺旋,16个茁折叠,41个茁-转角。氨基酸同源性比对分析表明,苹果UVR8与已报道的其他植物的氨基酸序列相似性在69.54%~88.94%之间。核苷酸聚类分析表明,苹果和白梨首先聚为一类,其次是梅。本研究为苹果光受体对光应答的分子机理的进一步研究奠定了基础。