基于转录组分析的大针茅响应羊啃食的基因表达

编号 zgly0001554960

文献类型 期刊论文

文献题名 基于转录组分析的大针茅响应羊啃食的基因表达

作者 田青松  田文坦  李婷婷  高金玉  武志娟  韩冰 

作者单位 中国农业科学院草原研究所/农业部草地生态与修复治理重点实验室  内蒙古农业大学生命科学学院 

母体文献 中国草地学报 

年卷期 2017年03期

年份 2017 

分类号 S543.9 

关键词 大针茅  羊啃食  转录组测序  实时荧光定量PCR 

文摘内容 利用新一代高通量测序手段对大针茅受到羊啃食后2h的实验组与未啃食的对照组叶片进行Illumina平台的转录组测序(RNA sequences),共得到147561个序列读取片段(reads),组装成64738条单基因簇(Unigenes),Unigenes平均长度为1367.21bp,N50为2017bp。随机挑选11个基因利用实时荧光定量PCR对转录组数据库进行了验证。基于转录组数据分析淀粉和蔗糖代谢通路中关键调控基因表达差异,结果表明:随机挑选的11个基因的表达差异变化与转录组数据上下调趋势一致,在淀粉与蔗糖代谢通路中相关基因的表达差异变化利于淀粉、蔗糖的积累。大针茅在羊啃食后淀粉与蔗糖含量的增加有利于结实,对后代的传播意义重大。