鹅细小病毒HN株的分离鉴定及全基因组序列分析

编号 zgly0001528543

文献类型 期刊论文

文献题名 鹅细小病毒HN株的分离鉴定及全基因组序列分析

作者 贺冬梅  谭树义  陈朝喜  叶保国  张艳  林哲敏  曹宗喜 

作者单位 海南省农业科学院畜牧兽医研究所  西南民族大学生命科学与技术学院 

母体文献 动物医学进展 

年卷期 2016年12期

年份 2016 

分类号 S852.65 

关键词 鹅细小病毒  分离鉴定  全基因组  IRT  NS1  VP1 

文摘内容 为研究鹅细小病毒(GPV)基因遗传变异特征,采集海南某养鹅场疑似鹅细小病毒感染的病料,将其处理后接种番鸭胚成功分离到一株病毒,经PCR鉴定为鹅细小病毒,命名为HN株,并获得了其全基因组序列,将该序列与GenBank数据库中登录的16条鹅和番鸭细小病毒基因序列进行了比对分析。结果显示,该株病毒基因组全长为5 106bp,由ITR、NS、VP构成,其中ITR为444bp,NS1为1 844bp,VP1为2 199bp;HN株与SHFX1201株的NS1基因和VP1同源性最高,分别达到99.8%和99.7%,与番鸭细小病毒株FM的NS1基因同源性最低,为82.7%;与90-0215株VP1同源性最低,为80.1%。HN株的遗传进化树可以看出,GPV可以分成明显的2个基因亚群,HN株与鹅细小病毒匈牙利株(B)、欧洲疫苗株(VG32/1)和台湾株(82-0321V、82-0321、06-0329)均处在第I亚群,且与安徽分离株Y株以及SHFX1201株同源性最接近,番鸭源匈牙利株FM单独处于第Ⅱ亚群。本研究丰富了GPV的数据资料,为研究GPV分类地位以及遗传进化关系提供了依据,同时也为研究GPV流行趋势和疫苗的开发奠定了基础。