家蚕转录因子AP-4基因cDNA的分子克隆与生物信息学分析

编号 zgly0001339120

文献类型 期刊论文

文献题名 家蚕转录因子AP-4基因cDNA的分子克隆与生物信息学分析

作者 李佳梅  赵浩勤  张国政  夏定国  张业顺  唐顺明  沈兴家 

作者单位 中国农业科学院蚕业研究所  江苏科技大学  中国农业科学院蚕业研究所 农业部家蚕生物技术重点开放实验室  江苏镇江212018  江苏镇江212003  农业部家蚕生物技术重点开放实验室 

母体文献 蚕业科学 

年卷期 2008年02期

年份 2008 

分类号 S881 

关键词 家蚕  转录因子AP-4  cDNA末端快速扩增  基因克隆  生物信息学 

文摘内容 AP-4(activator protein 4)是一种转录因子,在生物的生长发育中有重要作用。根据家蚕表达序列标签(EST)并利用cDNA末端快速扩增(RACE)方法克隆了家蚕AP-4(Bombyx mori activator protein4)基因,结合生物信息学方法对所获的序列进行开放阅读框、序列同源性分析,预测了AP-4蛋白的理化性质。获得的家蚕AP-4基因cDNA的全长为1621bp,其开放阅读框为996bp,编码331个氨基酸,基因由3个外显子和2个内含子组成。同源性比对表明该基因推导的氨基酸序列与棉铃虫AP-4和谷蛀虫AP-4推测的蛋白同源性分别为76%和54%,第45-99位氨基酸序列是一个典型的保守结构域。实时定量RT-PCR显示该基因在所检测家蚕的各发育时期中,除幼虫1龄和蛹期第4天无表达外,其它时期均有表达,其中幼虫3龄和4龄期的表达量较高。