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两株传染性造血器官坏死病病毒的分离及其糖蛋白基因序列分析



编号 zgly0001423527

文献类型 期刊论文

文献题名 两株传染性造血器官坏死病病毒的分离及其糖蛋白基因序列分析

作者 申斯思  郑晓聪  刘荭  史秀杰  贾鹏  兰文升  何俊强  张朋  余剑敏  杜娟  肖启明  康林 

作者单位 湖南农业大学生物安全科技学院  深圳市外来有害生物重点实验室  深圳出入境检验检疫局  华中农业大学水产学院 

母体文献 中国动物检疫 

年卷期 2012年01期

年份 2012 

分类号 S941.414 

关键词 传染性造血器官坏死病病毒  糖蛋白  同源性  进化分析 

文摘内容 对所分离编号为20101008和20101032的两株传染性造血器官坏死病病毒(IHNV)的糖蛋白编码基因进行遗传进化分析,以揭示我国毒株与其他不同国家和地区毒株间的遗传进化关系。以反转录RCR(RT-PCR)法扩增其糖蛋白(G)编码基因,然后克隆入PMD-18T载体并测序。应用DNAStar和MEGA4.0软件,将20101008和20101032的G基因与多株GenBank中已发表的IHNV毒株相应基因进行比较。结果表明两株病毒间G编码基因的核苷酸和推导出来的氨基酸同源性分别为98%和81.9%,其氨基酸序列分别发生了35和20处氨基酸的替换。20101008和20101032与日本、韩国分离株同源性较高,核苷酸及推导出来的氨基酸同源性分别为93.3%~96.4%和75.9%~84.6%;两株病毒在进化关系上亲缘关系最近,属于同一分支,均为基因U型传染性造血器官坏死病病毒,但其G基因的核苷酸序列以及推导出来的氨基酸序列与已知的基因U型IHNV都有一定的差异。

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