编号 zgly0001423527
文献类型 期刊论文
文献题名 两株传染性造血器官坏死病病毒的分离及其糖蛋白基因序列分析
作者 申斯思 郑晓聪 刘荭 史秀杰 贾鹏 兰文升 何俊强 张朋 余剑敏 杜娟 肖启明 康林
作者单位 湖南农业大学生物安全科技学院 深圳市外来有害生物重点实验室 深圳出入境检验检疫局 华中农业大学水产学院
母体文献 中国动物检疫
年卷期 2012年01期
年份 2012
分类号 S941.414
关键词 传染性造血器官坏死病病毒 糖蛋白 同源性 进化分析
文摘内容 对所分离编号为20101008和20101032的两株传染性造血器官坏死病病毒(IHNV)的糖蛋白编码基因进行遗传进化分析,以揭示我国毒株与其他不同国家和地区毒株间的遗传进化关系。以反转录RCR(RT-PCR)法扩增其糖蛋白(G)编码基因,然后克隆入PMD-18T载体并测序。应用DNAStar和MEGA4.0软件,将20101008和20101032的G基因与多株GenBank中已发表的IHNV毒株相应基因进行比较。结果表明两株病毒间G编码基因的核苷酸和推导出来的氨基酸同源性分别为98%和81.9%,其氨基酸序列分别发生了35和20处氨基酸的替换。20101008和20101032与日本、韩国分离株同源性较高,核苷酸及推导出来的氨基酸同源性分别为93.3%~96.4%和75.9%~84.6%;两株病毒在进化关系上亲缘关系最近,属于同一分支,均为基因U型传染性造血器官坏死病病毒,但其G基因的核苷酸序列以及推导出来的氨基酸序列与已知的基因U型IHNV都有一定的差异。