中山杉406ThSHR3基因的克隆、表达及蛋白互作研究

编号 zgly0001734283

文献类型 期刊论文

文献题名 中山杉406ThSHR3基因的克隆、表达及蛋白互作研究

作者 宣磊  王芝权  殷云龙  华建峰 

作者单位 江苏省中国科学院植物研究所 

母体文献 林业科学研究 

年卷期 2021,34(4)

页码 32-39

年份 2021 

分类号 S722 

关键词 中山杉  SHR  基因克隆  基因表达  蛋白互作 

文摘内容 [目的]本研究在前期中山杉(Taxodium hybrid‘Zhongshanshan’)不定根转录组及蛋白组研究的基础上,克隆获得中山杉ThSHR3(SHORT-ROOT 3)基因,对其进行表达特性检测及相关功能分析,为深入研究ThSHR3基因在中山杉不定根发育过程中的调控机理提供理论基础。[方法]以中山杉406扦插苗不定根为材料,利用RACE技术克隆获得ThSHR3基因全长,并对其进行生物信息学分析。采用半定量PCR和荧光定量PCR分别对ThSHR3进行表达特性检测。通过原生质体瞬时表达检测ThSHR3蛋白的亚细胞定位情况,进一步使用双分子荧光互补(BiFC)技术验证ThSHR3的蛋白互作情况。[结果]ThSHR3基因的全长为2019 bp,其中,开放阅读框(ORF)为1446 bp,共编码482个氨基酸残基。ThSHR3蛋白C端较保守,具有LHRI、VHIID、LHRII、PFYRE和SAW等几个典型的蛋白结构域。系统进化分析表明:ThSHR3属于GRAS转录因子家族中的SHR亚家族。ThSHR3基因在中山杉不定根发育过程中呈逐渐上升的表达模式。原生质体瞬时表达实验表明:ThSHR3蛋白定位于细胞核。BiFC实验证明:ThSHR3蛋白和GRAS家族另一成员ThSCR蛋白存在着明显互作。[结论]中山杉ThSHR3和不定根发育密切相关,且在中山杉不定根的发育过程中发挥着重要作用。