基于叶绿体DNA分析的辽宁省梨属种质遗传多样性研究

编号 zgly0001476031

文献类型 期刊论文

文献题名 基于叶绿体DNA分析的辽宁省梨属种质遗传多样性研究

作者 常耀军  曹玉芬  张金梅  田路明  董星光  张莹  齐丹  郑迎春 

作者单位 中国农业科学院果树研究所农业部园艺作物种质资源利用重点实验室  中国农业科学院作物科学研究所国家作物种质库 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2014年07期

年份 2014 

分类号 S661.2 

关键词 梨  叶绿体DNA  单倍型  遗传多样性 

文摘内容 从32对叶绿体DNA通用引物中筛选出8对引物用于评价辽宁省梨属种质的遗传多样性,其中4对引物所扩增的叶绿体DNA片段存在突变位点。合并后的叶绿体基因片段（3 688 bp）含有单一突变位点9个、简约信息性位点3个以及插入/缺失（INDEL）2个。在37个样品中,trnL-trnF-487区域、trnL-trnF-413区域、rbcL区域和trnS-psbC区域的单倍型分别为2个、4个、2个和3个,合并之后的叶绿体基因片段的单倍型为4个。非编码区trnL-trnF-413多态性最高,具有最高的单倍型数、最高的单倍型（基因）多样性、最高的核苷酸多样性、最高的单倍型多样性方差和最高的单倍型多样性标准差。辽宁省37份梨种质的单倍型（基因）多样性（Hd）、核苷酸多样性（Pi）分别为0.577、0.00055。Tajima’s D检验中除了rbcL区域的D值在P<0.05水平上显著外,其余区域的D值未达显著水平,表明自然选择对rbcL区域的突变位点产生了作用。秋子梨和白梨种质共有单倍型HAP1、HAP2和HAP3,显示出一定的亲缘关系;西洋梨则单独共享HAP5。运用中介邻接网络（Median-Joining network,MJ）算法绘制的中介网络图显示HAP1与HAP2、HAP3的亲缘关系较远,而HAP5则与上述3个单倍型的亲缘关系较远。