基于叶绿体DNA信息的南方梨属种质的遗传多样性和演化分析

编号 zgly0001655247

文献类型 期刊论文

文献题名 基于叶绿体DNA信息的南方梨属种质的遗传多样性和演化分析

作者 齐丹  常耀军  曹玉芬  胡红菊  田路明  董星光  张莹  霍宏亮  徐家玉  张小双  刘超 

作者单位 中国农业科学院果树研究所农业部园艺作物种质资源利用重点实验室  湖北省农业科学院果树茶叶研究所 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2018年12期

年份 2018 

分类号 S661.2 

关键词 梨  种质  叶绿体DNA  遗传多样性  演化分析 

文摘内容 选取5个叶绿体DNA非编码区trn L-trn F-1、trn L-trn F-2、trn S-psb C、acc D-psa I、rps16-trn Q和1个基因区域rbc L,对中国秦岭淮河以南地区的梨（Pyrus L.）资源进行遗传多样性和演化分析。将188份梨资源的测序结果整合得到长度为5 612 bp（包含缺失片段）,共检测出13个单倍型、4个单一突变位点、16个简约性信息位点和14个插入/缺失片段（InDels）,单倍型多样性Hd为0.7178,核苷酸多样性为0.35×10-3。acc D-psa I区域的分析结果显示该区域的Hd值最高,为0.7177;rbc L区域的Hd值最低,为0.0317。其中162份梨资源检测出12个单倍型,Hd为0.713,核苷酸多样性为0.29×10-3;梨的不同地理群体中湖南省的10个梨地方品种的Hd最高,为0.889;来自贵州省的8个品种的Hd最低,为0。138份砂梨地方品种共检测出8个叶绿体单倍型,其中单倍型H2、H4和H5在130份砂梨和37份白梨品种中检测到,单倍型H6、H10、H11、H12和H13在8份砂梨地方品种‘青皮钟’、‘甜宵梨’、‘细花红梨’、‘惠阳红梨’、‘麝香梨’、‘塘湖青’、‘红粉’和‘横县浸泡梨’中检测到。Median-joiningNetwork图显示单倍型H6和H11为古老单倍型,H1、H4和H5为较进化的单倍型。根据叶绿体DNA序列变异信息可推测秦岭淮河以南地区的砂梨和白梨亲缘关系较近,同时来自湖南地区的砂梨种质资源具有丰富的遗传多样性。