蓖麻RcGA20ox1基因克隆及生物信息学分析

编号 zgly0001635096

文献类型 期刊论文

文献题名 蓖麻RcGA20ox1基因克隆及生物信息学分析

作者 丛安琪  李国瑞  王月  李威  李晓晨  黄凤兰  陈永胜 

作者单位 内蒙古民族大学生命科学学院  内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心  内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室  内蒙古自治区蓖麻产业协同创新培育中心  内蒙古民族大学农学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年10期

年份 2018 

分类号 Q943.2  S565.6 

关键词 蓖麻  GA20ox  基因克隆  生物信息学分析 

文摘内容 GA20氧化酶是赤霉素生物合成途径中的重要氧化酶,我们尝试克隆该酶,发掘蓖麻中GA20ox家族候选基因,并推测其功能。根据NCBI上已知蓖麻GA20ox1基因（XM002510827.2）序列设计引物,扩增得到GA20ox基因片段,连接pMD18-T载体,得到Rc GA20ox1 cDNA完整的开放阅读框序列1 137 bp,并对其进行序列比对、转录物理化性质分析、疏水性、功能域分析及其三级结构预测。推测其可编码378个氨基酸,为亲水性稳定蛋白;基因隶属PcbC superfamily家族,为非分泌蛋白、细胞质蛋白、含有28个磷酸化位点;预测结构由8个α-螺旋和8个β-折叠构成;与大戟科巴西橡胶树、木薯和麻疯树高度同源。本研究为蓖麻GA生物合成乃至蓖麻矮化相关研究提供一定的理论与实践依据。