山杏LACS基因家族生物信息学及表达分析

编号 zgly0001634635

文献类型 期刊论文

文献题名 山杏LACS基因家族生物信息学及表达分析

作者 邓舒雅  肖羽  张鹤婷  陈惠萍  钮俊 

作者单位 海南大学热带农林学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年06期

年份 2018 

分类号 S662.2 

关键词 山杏  长链酰基辅酶A合成酶  生物信息学分析  qRT-PCR分析 

文摘内容 在植物脂肪酸的代谢途径中,长链酰基辅酶A合成酶把游离脂肪酸活化成酰基辅酶A,是调控脂肪酸代谢的重要酶。依据山杏(Prunus sibirica)转录组数据,开展LACS保守域比对分析,共确定6个具有完整ORF的LACS基因,其长度为2 360~2 900 bp,编码氨基酸为654~730 aa。开展LACS蛋白保守域及进化树分析,确定了山杏LACS具有AMP绑定域,说明其在物种间的高度保守性。同时,对不同发育期山杏杏仁的LACS基因开展q RT-PCR表达谱分析。为探究杏仁发育过程中油脂的累积模式,以山杏为试材,采用索氏提取法对其油脂含量进行测定,确定杏仁油的主要累积期在20~50 DAF。结合油脂含量的检测结果,对蛋白互作网络和基因表达等方面加以分析,确定山杏LACS9与油脂累积密切相关。本研究结果可为后续探究LACS基因家族在山杏杏仁发育及油脂累积中的调控机制奠定基础。