环介导等温扩增技术检测大丽轮枝菌

编号 zgly0001528245

文献类型 期刊论文

文献题名 环介导等温扩增技术检测大丽轮枝菌

作者 田擎  张海峰  曾丹丹  姚艳  任林荣  王源超  郑小波 

作者单位 南京农业大学植物保护学院卵菌与真菌分子生物学实验室 

母体文献 植物病理学报 

年卷期 2016年06期

年份 2016 

分类号 S432.4 

关键词 大丽轮枝菌  环介导等温扩增  Gpd  羟基萘酚蓝(HNB) 

文摘内容 本研究基于环介导等温扩增技术（loop-mediated isothermal amplification,LAMP）,通过比对分析大丽轮枝菌（Verticillium dahliae）与其相近种不同靶标序列间的差异,选取G pd（glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,甘油醛-3-磷酸脱氢酶）基因作为靶标基因,设计并筛选了四条特异性强、灵敏度高的LAMP引物和两条环引物,建立了一种基于颜色判定的简单、快速和灵敏的大丽轮枝菌的检测方法,并进行了特异性、灵敏度实验及田间发病组织的检测。该方法在62℃等温条件下进行核酸扩增反应70 min,扩增前加入染料HNB（羟基萘酚蓝）,反应后根据染料颜色变化判定扩增结果。特异性试验中,仅含有大丽轮枝菌菌株DNA的反应管扩增后呈天蓝色的阳性反应,而其他供试菌株均呈紫色的阴性反应。该方法的最低检测限为100 pg·μL-1,在土壤中检测的灵敏度为10个孢子/0.25g土壤。该技术能够检测出棉花发病组织中的目标菌,对采自江苏和山东的24份疑似病害样本进行检测,11份为阳性。该方法的建立为大丽轮枝菌的检测及其所致病害的诊断提供了新的技术。