苹果α-法尼烯合酶基因组结构和序列的多态性分析

编号 zgly0000532817

文献类型 期刊论文

文献题名 苹果α-法尼烯合酶基因组结构和序列的多态性分析

作者 苑克俊  刘庆忠  李勃  张力思 

作者单位 山东省果树研究所 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2007,34(4)

页码 1003-1006

年份 2007 

分类号 S661.1 

关键词 苹果  α-法尼烯合酶  基因组DNA  多态性  虎皮病 

文摘内容 通过设计引物进行PCR扩增、测序、拼接序列，以及与GenBank中的cDNA序列(登录号AY182241)进行比对，获得α-法尼烯合酶基因(AFS)的基因组序列和内含子/外显子结构。获得的AFS基因序列已在GenBank注册(登录号DQ901739)，它有6个内含子和7个外显子，编码一个大小为576个氨基酸的蛋白质。间隔外显子的6个内含子相位分别是0、1、2、2、0、0，其大小分别是108、113、〉1000、125、220和88bp，7个外显子的推导氨基酸序列大小分别是57、89、127、73、48、83和99。编码的蛋白质中有3个序列模式(motif)，RR(X8)W模式的编码基因序列在基因5′端的外显子1上，RxR模式和DDxxD模式的编码基因序列在外显子4上。将获得的AFS基因序列与GenBank中的cDNA序列(登录号AY523409)进行比对，结果发现两序列间有6个单核苷酸多态性，其中4个引起氨基酸突变。有意义的是，1个氨基酸突变(291R→G)发生在RxR模式上，此氨基酸突变以及其它突变是否与苹果α-法尼烯合成能力和虎皮病发生能力有关，值得进一步探讨。