青杄PwPSAF基因的克隆与组织表达分析

编号 zgly0000817425

文献类型 期刊论文

文献题名 青杄PwPSAF基因的克隆与组织表达分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 李长江  孙帆  张通  张凌云 

作者单位 北京林业大学林学院森林培育与保护教育部重点实验室 

母体文献 林业科学 

年卷期 2013(10)

页码 40-47

年份 2013 

分类号 S718.46 

关键词 青杄  PSAF  生物信息学分析  组织表达  胁迫响应 

文摘内容 PSAF是绿色植物光系统Ⅰ反应中心F亚基,在光合作用电子迁移过程中起着重要作用。以青杄cDNA文库为模板,根据PwPSAF的EST序列设计引物,进行5＇-RACE和3＇-RACE试验,以获得青杄PwPSAF的末端序列,经过与EST序列进行拼接获取青杄PwPSAF的全长cDNA序列。基于其氨基酸序列,利用Expasy tools、DNAMAN、ClustalX和MEGA等工具,进行理化性质、二级结构和三级结构的生物信息学分析。结果表明: PwPSAF是一个由253 aa组成的蛋白质,理论分子量为27.04 kDa,等电点为9.57,预测蛋白有2个跨膜区域,蛋白质的C端具有保守的结构。RT-qPCR试验显示PwPSAF主要在青杄的针叶中表达。在种子萌发过程中吸胀期(0～ 2天)表达量最高,在4天时表达量降低,随着子叶的不断长出,其表达量又逐渐增高。在干旱和盐胁迫下,针叶中的PwPSAF的表达量被大幅下调。研究结果显示PwPSAF在青杄种子萌发及非生物逆境胁迫下的光合过程中起着重要作用。