杨桃果实转录组测序初步分析

编号 zgly0001552581

文献类型 期刊论文

文献题名 杨桃果实转录组测序初步分析

作者 林旗华  钟秋珍  张泽煌 

作者单位 福建省农业科学院果树研究所 

母体文献 东南园艺 

年卷期 2017年01期

年份 2017 

分类号 S667.9 

关键词 杨桃  转录组  测序  果实 

文摘内容 本试验采用Illumina HiSeq 4 000高通量测序技术对甜杨桃3个不同时期果实及酸杨桃成熟期果实进行了转录组测序。对获得的12个文库进行拼接,共得到99 319个Unigenes,总长度约为72.0 Mb,平均长度为725.3bp,N50长度为1 374 bp。利用公共数据库对获得的Unigenes进行Blast比对,52.0%(51 642个)的Unigenes得到功能注释,其中41.7%(41 386个)的Unigenes与NR数据库有同源比对信息,与杨桃同源序列比例最高的3个物种分别为可可、葡萄和柑橘。