番茄CBL家族基因的鉴定和遗传进化分析

编号 zgly0000927258

文献类型 期刊论文

文献题名 番茄CBL家族基因的鉴定和遗传进化分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 刘淑梅  王施慧  刘明毓  纪复勤  李利斌  侯丽霞 

作者单位 山东省农业科学院蔬菜花卉研究所山东省设施蔬菜育种工程技术研究中心国家蔬菜改良中心山东分中心  山东省东平县种子公司  山东省宁阳县万丰种业有限公司 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2015(10)

页码 2268-2273

年份 2015 

关键词 番茄  类钙调磷酸酶B亚基蛋白  序列特征  遗传进化 

文摘内容 植物CBL基因在逆境应答过程具有重要功能,但在番茄中缺乏相关报道。本研究利用生物信息学的方法从番茄基因组中鉴定出13个CBL基因,并对它们的基因组分布、分子特征、遗传进化以及顺式元件等进行了分析。结果发现,番茄CBL基因在基因组中的分布是不均匀的,外显子数大多为8或者9,编码区序列大小在561~774 bp之间。在进化上番茄CBL基因分为两个不同的类群;它们编码的蛋白除了一个预测定位在胞外基质中,其余定位在细胞的不同部位;在番茄CBL基因的上游序列中存在几个或者多个应答不同逆境和植物激素的顺式元件,而且不同成员含有的顺式元件的种类和数目各不相同。