辽宁乡土杨树重测序遗传进化全基因组关联分析

编号 zgly0001750747

文献类型 期刊论文

文献题名 辽宁乡土杨树重测序遗传进化全基因组关联分析

作者 蔄胜军  冯连荣  刘巍  尹杰  林晓峰  倪鹏跃  安云全 

作者单位 辽宁省杨树研究所  辽宁省实验林场 

母体文献 辽宁林业科技 

年卷期 2022,(6)

页码 1-7

年份 2022 

分类号 S792.11 

关键词 乡土杨树  遗传进化  全基因组关联分析 

文摘内容 为揭示辽宁省乡土杨树遗传进化和多样性,该文对辽宁省主要乡土杨树14个样品进行重测序,开展了遗传进化全基因组关联分析和数据评估。本次分析数据量为75.57 Gbp的Clean Data,Q30达到93.77%。测序数据质量质控以及与参考基因组对比统计结果显示:与参考基因组平均比对率为96.72%,基因组覆盖深度为84.92%(至少一个碱基覆盖),平均覆盖深度为10X。通过样品的SNP和InDel的检测和注释,进行了遗传进化和遗传多样性分析,并对乡土杨树群体进行了评价。从系统发育变异检测结果看,白杨派发育早,与黑杨派、青杨派在系统发育中亲缘关系较远,青杨派种间有基因交流现象。该项研究为乡土杨树资源保护和利用提供参考。