内蒙古呼和浩特地区苹果坏死花叶病毒的检测与遗传多样性研究

编号 zgly0001704288

文献类型 期刊论文

文献题名 内蒙古呼和浩特地区苹果坏死花叶病毒的检测与遗传多样性研究

作者 李正男  张磊  耿帅鑫  马强  李小燕  孙平平 

作者单位 内蒙古农业大学园艺与植物保护学院 

母体文献 中国果树 

年卷期 2020年03期

年份 2020 

分类号 S432.41 

关键词 海红果  苹果坏死花叶病毒  RT-PCR  外壳蛋白 

文摘内容 采用RT-PCR方法对从内蒙古呼和浩特地区采集的29份表现花叶症状的海红果(Malus micromalus Makino)叶片样品进行了苹果坏死花叶病毒(ApNMV)的检测,ApNMV的检出率为100%,说明ApNMV在呼和浩特地区表现花叶症状的海红果上普遍发生。分别克隆并测序了29份海红果样品中ApNMV的全长外壳蛋白(CP)基因,结果表明,29个ApNMV分离物CP基因间核苷酸序列一致性为94.1%～99.8%,与NCBI数据库中其他19个ApNMV分离物全长CP基因核苷酸一致性为86.1%～97.1%。利用ApNMV CP基因的全长序列构建了系统发育树,48个ApNMV分离物共分成5个组,本研究中的29个ApNMV分离物与2个日本分离物LC108995和NC040470聚集在一起,形成组Ⅰ;其余ApNMV分离物分别形成了组Ⅱ～组Ⅴ。