猕猴桃EST-SSR引物筛选及通用性分析

编号 zgly0000738848

文献类型 期刊论文

文献题名 猕猴桃EST-SSR引物筛选及通用性分析

学科分类 220.45;经济林学

作者 廖娇  黄春辉  辜青青  曲雪艳  徐小彪 

作者单位 江西农业大学农学院 

母体文献 果树学报 

年卷期 2011,28(6)

页码 1111-1116

年份 2011 

分类号 S663.4 

关键词 猕猴桃  EST-SSR  引物筛选  柑橘  通用性 

文摘内容 应用SSRHunter软件对NCBI公共数据库中的猕猴桃EST序列进行筛查, 利用Primer5.0软件设计引物并进行筛选, 同时对其在部分柑橘类植物的通用性进行分析。以漓江猕猴桃DNA为模板, 对所设计的97对EST-SSR引物进行筛选, 结果表明其中77对引物能扩增出清晰条带, 有效扩增率为79-38%。随机选取20对引物对10份猕猴桃资源进行检测, 结果发现有17对引物对所有材料都有扩增产物并呈现出多态性, 多态性扩增率为85%。随机应用20对有效EST-SSR引物对兴津、金柑、枳壳、桠柑、酸柚、甜橙、胡柚、尾张、宫川等柑橘类植物基因组DNA进行扩增, 结果表明, 其中有11对引物在供试材料中有扩增产物, 占引物总数的55%: 有8对引物的扩增产物具有多态性, 扩增率为72.7%。据此, 基于猕猴桃EST序列而筛选的SSR引物在柑橘类植物中具有一定的通用性。