正交设计优化狗牙根SSR-PCR反应体系

编号 zgly0001329374

文献类型 期刊论文

文献题名 正交设计优化狗牙根SSR-PCR反应体系

作者 王志勇  郭海林  刘建秀 

作者单位 南京农业大学园艺学院  中国科学院植物所(南京中山植物园)  中国科学院植物所(南京中山植物园) 南京  210095 中国科学院植物所(南京中山植物园)  南京  210014 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2007年S1期

年份 2007 

分类号 S688.4 

关键词 狗牙根  SSR-PCR  正交设计  体系优化 

文摘内容 以SDS法提取的狗牙根（Cynodon spp.）叶片DNA为模板,应用正交试验设计,从Mg2+、dNTP、引物和DNA聚合酶4种因素三个水平,对SSR扩增效果进行研究,并通过比较不同浓度模板DNA的浓度对PCR扩增的影响,确立适合狗牙根SSR-PCR反应的最佳体系。结果表明:各因素不同水平浓度对PCR反应结果均有显著影响,狗牙根SSR-PCR优化反应体系为:10×buffer、60 ng模板DNA、Mg2+2.5 mmol/L、dNTP 200μmol/L、primer 0.8μmol/L和Taq DNA聚合酶0.5U,总体积10μL。运用该体系对包括三种10份优良坪用型狗牙根进行了检验,证明该体系稳定可靠。这一优化体系的建立为今后利用SSR标记技术进行狗牙根遗传多样性研究、种质资源鉴定以及亲缘关系分析等提供依据。