利用重测序–BSA分析鉴定金柑油胞发育相关基因

编号 zgly0001668997

文献类型 期刊论文

文献题名 利用重测序–BSA分析鉴定金柑油胞发育相关基因

作者 刘梦雨  刘小丰  江东  朱世平  申晚霞  余歆  薛杨  赵晓春 

作者单位 西南大学柑桔研究所中国农业科学院柑桔研究所国家柑桔工程技术研究中心 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2019年05期

年份 2019 

分类号 S666 

关键词 金柑  油胞发育  重测序–BSA分析  同源分析  功能注释 

文摘内容 为了鉴定与金柑油胞发育相关的基因,用多油胞的罗纹金柑[Fortunella japonica（Thunb.）Swingle,母本]和少油胞的滑皮金柑（Fortunella crassifolia Swingle ‘Huapi’,父本）进行杂交构建了F1代分离群体,从159个F1代单株中挑选出高油胞密度和低油胞密度的单株各30株,分别构建两个极端性状的DNA混池用于基因组重测序。利用重测序数据结合混合分组分析法（Bulked Segregant Analysis,BSA）进行遗传关联性分析,将控制油胞数量性状的位点定位在第9条染色体的25 980 001～29 160 001 bp的区域内。该区域包含511个有效的SNP,分布在301个基因位点上。同源性功能分析后获得11个与细胞程序性死亡、细胞壁功能和结构及细胞伸长和膨大等生理过程相关的候选基因（Ciclev10005243m.g、Ciclev10005288m.g、Ciclev10005338m.g、Ciclev10005441m.g、Ciclev10006448m.g、Ciclev10005804m.g、Ciclev10004719m.g、Ciclev10005888m.g、Ciclev10006502m.g、Ciclev10005197m.g和Ciclev10004431m.g）,这些基因可能在柑橘油胞的发育过程中起重要作用。