草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫的转录组比较分析

编号 zgly0001710196

文献类型 期刊论文

文献题名 草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫的转录组比较分析

作者 廖永林  李燕芳  杨斌  赵华  高燕  陈伟平  蔡时可  王继华 

作者单位 广东省农业科学院植物保护研究所广东省植物保护新技术重点实验室  中国农业科学院植物保护研究所  广东省农业技术推广总站  广东省农业科学院作物研究所广东省农作物遗传改良重点实验室 

母体文献 昆虫学报 

年卷期 2020年05期

年份 2020 

分类号 S433.4 

关键词 草地贪夜蛾  发育阶段  嗅觉基因  转录组  基因注释  生物信息学 

文摘内容 【目的】草地贪夜蛾Spodoptera frugiperda是一种新近入侵我国的重要害虫。本研究旨在对草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫两个不同发育阶段的转录组进行比较分析。【方法】利用高通量测序技术对草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫进行转录组测序和数据组装,并对转录组数据进行功能注释和比较分析。【结果】经de novo组装共获得209 002条转录本,平均长度为687.55 bp,N50为982 bp。共有46 198条(57.43%) unigene在至少一个数据库中获得功能注释,其中1 713条(2.13%) unigene在所有数据库中均能获得注释。在GO数据库中获得205 269条unigene的注释,主要包括68个功能分类;在KEGG数据库中共有3 408条unigene得到注释,涉及277个代谢通路。共鉴定到424个嗅觉相关的基因,并且在雄性成虫和5龄幼虫之间的表达存在差异。通过比较转录组分析,在雄性成虫中鉴定到9 162个上调和6 399个下调差异表达基因(DEGs);功能富集分析发现在上调DEGs中涉及信息素以及信号转导的代谢通路显著富集,而下调DEGs中涉及解毒相关的通路显著富集。【结论】这些转录组数据为探究草地贪夜蛾的生长发育、嗅觉相关功能基因以及候选分子靶标提供资源信息。