几个常用内参基因在淀粉酶产色链霉菌1628抗药性突变株中稳定性的评估

编号 zgly0001526664

文献类型 期刊论文

文献题名 几个常用内参基因在淀粉酶产色链霉菌1628抗药性突变株中稳定性的评估

作者 汤谷  姚佳忆  申屠旭萍  俞晓平 

作者单位 中国计量大学生命科学学院/浙江省生物计量及检验检疫技术重点实验室 

母体文献 中国生物防治学报 

年卷期 2016年04期

年份 2016 

分类号 S476 

关键词 淀粉酶产色链霉菌  荧光定量PCR  内参基因 

文摘内容 淀粉酶产色链霉菌Streptomyces diastatochromogenes 1628是一株重要的生防菌株,其代谢产物对多种植物病原真菌具有较强的抑制效果。为了筛选在其不同抗药性高产突变株中均能稳定表达的内参基因,选择16S rRNA、sigB、hrdB、thyA、gyrB和rpoA共6个常见内参基因,分别探究它们在野生型菌株、链霉素抗性突变株、利福平抗性突变株和巴龙霉素抗性突变株中的表达情况,并用geNorm软件和NormFinder软件对结果进行分析。结果表明,使用不同软件分析得出的最佳内参基因略有差异。geNorm软件认为在上述4株菌株中,表达最稳定的内参基因分别是gyrB、gyrB、thyA、rpoA;而NormFinder软件认为rpoA基因在所有菌株的表达都是最稳定的。利用平均等级的算法平衡两个软件的分析差异,最终确定rpoA基因为表达最稳定的内参基因。通过检测toyG基因的表达水平,发现以rpoA作为内参基因能得到更合理的结果。