‘富士’苹果Ca2+/H+反向转运蛋白基因生物信息学及表达模式分析

编号 zgly0001497374

文献类型 期刊论文

文献题名 ‘富士’苹果Ca2+/H+反向转运蛋白基因生物信息学及表达模式分析

作者 程玉豆  冯云霄  关军锋 

作者单位 河北省农林科学院遗传生理研究所  河北省植物转基因研究中心 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2015年09期

年份 2015 

分类号 S661.1 

关键词 苹果  Ca2+/H+反向转运蛋白  生物信息学分析  钙  基因表达 

文摘内容 本研究借助生物信息学分析从苹果基因组数据库中获得了6个含全长编码序列的Ca2+/H+反向转运蛋白(Ca2+/H+antiporter,CAX)基因,分别命名为MdCAX1、MdCAX2、MdCAX3、MdCAX4、MdCAX5和MdCAX6。基因和蛋白结构特性分析结果显示:6个CAX在基因结构和蛋白特性等方面存在差异;MdCAXs隶属于I-A型和I-B 2个亚型,均含有N-端自我抑制区(N-terminal regulatory region,NRR)、CaD功能域、C-端功能域、C功能域和D功能域。荧光定量PCR分析表明,MdCAX1在‘富士’苹果叶片中表达量表现为基部叶片>中部叶片>顶端叶片,在果皮和果肉中的表达量低于叶片;MdCAX2在果皮和果肉中表达量高于叶片;MdCAX3在叶片和果实中的表达模式与MdCAX1相似,但在叶片中的表达量低于MdCAX1;MdCAX4在各被检测样本中表达量无明显变化;MdCAX5和MdCAX6在果皮和果肉组织中的表达量随发育进程呈逐渐升高趋势。叶片中Ca2+含量在不同叶位叶片中差异显著,果皮和果肉中Ca2+含量随着果实发育均呈下降趋势。上述研究结果表明:6个MdCAXs基因在基因结构、蛋白特性以及表达模式上存在差异,MdCAX1和MdCAX3基因表达与‘富士’苹果叶片和果实Ca2+含量变化密切相关。