杨树钙依赖蛋白激酶基因家族生物信息学分析

编号 zgly0000721068

文献类型 期刊论文

文献题名 杨树钙依赖蛋白激酶基因家族生物信息学分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 薛彬  夏新莉  尹伟伦 

作者单位 北京林业大学生物科学与技术学院 

母体文献 经济林研究 

年卷期 2010,28(1)

页码 20-25

年份 2010 

分类号 Q75 S792.11 

关键词 杨树  CDPK  拟南芥  基因家族 

文摘内容 为给进一步分离和克隆植物中的CDPK基因奠定基础,以已经鉴定的拟南芥的CDPK(Calcium-dependent protein kinases)基因编码的结构域为检索序列,在基因组水平上对杨树的CDPK基因家族的成员进行分析,结果共找到36个杨树CDPK基因。同时利用这些基因编码的蛋白质序列与拟南芥中的CDPK基因构建了系统进化树,并对这些蛋白序列的保守序列进行了分析。结果表明,杨树CDPK基因内含子的插入位置相对比较保守。与拟南芥相比,杨树CDPK基因家族成员含有更多的基因对。通过对拟南芥、杨树CDPK家族之间进化关系和内含子分布比较发现,一些CDPK家族成员在拟南芥和杨树未分离之前就已经形成。