利用SNP分子标记分析化橘红种质资源

编号 zgly0001528895

文献类型 期刊论文

文献题名 利用SNP分子标记分析化橘红种质资源

作者 赵俊生  杨晓燕  曾祥有  钟声  方静  罗剑斌  曾运友  向旭 

作者单位 茂名市水果科学研究所  农业部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室广东省农业科学院果树研究所 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2016年05期

年份 2016 

分类号 S666 

关键词 化州橘红  单核苷酸多态性  高分辨率熔解曲线  聚类分析 

文摘内容 本研究利用高分辨率熔解曲线(high resolution melting,HRM)方法对21份化橘红及3份近缘种质蜜柚和黄皮的25个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点进行了基因分型。结果表明,所有样品在其中21个SNP位点表现出较好的多态性,共呈现出11种基因型,其中化橘红基因型有9种,SNP位点平均杂合度为0.363 1,多样性信息含量(PIC)平均值为0.266 3;21个SNP位点可将24份样本分为3类,化州橘红种质单独聚为一类,表明SNP分子标记将成为化州橘红种质资源评价及品种鉴定的一项重要工具。另外,化橘红种质资源可能存在更多的品系,而不止是当前认为的正毛、密叶正毛、副毛、光青、假西洋、黄龙6个品系,且化橘红种质资源存在着同名异物和同物异名的现象。本研究为化橘红种质资源鉴定提供了有效的方法和依据,应用前景广阔。