高分辨率熔解曲线技术在大豆基因分型中的应用

编号 zgly0001648459

文献类型 期刊论文

文献题名 高分辨率熔解曲线技术在大豆基因分型中的应用

作者 李玉秋  王超越  夏正俊  刘月  桑永生  袁翠平  赵洪锟  王玉民  刘晓冬  齐广勋  王英男  董英山 

作者单位 吉林省农业科学院大豆研究所  东北师范大学生命科学院  中国科学院东北地理与农业生态研究所  吉林农业大学生命科学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年18期

年份 2018 

分类号 S565.1 

关键词 大豆  高分辨率熔解曲线  基因分型 

文摘内容 高分辨熔解曲线(high resolution melting, HRM)分析技术是一种高效,快速,便捷的核苷酸检测方法。本实验从染料用量、模板浓度、产物片段长度3个方面探索了适宜HRM分析的最佳条件,并利用HRM技术对单核苷酸(single nucleotide polymorphism, SNP)及插入/缺失(insertion-deletion, InDel)检测及基因分型等方面进行了分析。结果表明:10μL反应体系中,20×Eva Green饱和染料加入0.1~0.3μL,模板浓度加入10~200 ng不影响HRM分辨率;扩增产物长度在70~190 bp范围内,插入/缺失片段长度3~13 bp范围内,高分辨熔解曲线均有较好的分辨效果。利用HRM分析技术检测分析F4个体基因型,结果与PAGE电泳分析完全一致。本实验结果说明,HRM技术与传统凝胶电泳基因分型方法相比,具有操作简单、分辨率高、准确快速、成本低等优点,是基因型鉴定的最佳选择。