高等植物F3′HcDNA及其氨基酸序列的生物信息学分析

编号 zgly0000708002

文献类型 期刊论文

文献题名 高等植物F3′HcDNA及其氨基酸序列的生物信息学分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 苏丽  赵昶灵  杨晓娜  李会容  李云 

作者单位 云南农业大学农学与生物技术学院 

母体文献 云南农业大学学报: 自然科学版 

年卷期 2010,25(3)

页码 316-326

年份 2010 

分类号 Q946.5 

关键词 高等植物  类黄酮3′-羟化酶基因  cDNA序列  氨基酸序列  生物信息学分析 

文摘内容 用生物信息学方法对GenBank中拟南芥、油菜、大豆、矮牵牛和高梁等的类黄酮3′-羟化酶基因的cD-NA序列及其编码氨基酸序列的结构、理化性质、信号肽、疏水性/亲水性、亚细胞定位、跨膜结构域、功能域和进化关系进行了初步预测和分析。结果表明: 不同植物类黄酮3′-羟化酶基因cDNA序列的相似性为69.5%,其起始密码子均为ATG,终止密码子均为TAA、TAG或TGA,包括5,′3′非翻译区和一个开放阅读框;不同植物类黄酮3′-羟化酶基因cDNA序列编码的氨基酸序列的理化性质基本一致,相似性为72.5%,含有6段保守氨基酸序列,是＂PPGR＂、＂AGTDT＂、＂RPPN＂、＂AYNY＂、＂IKALLL＂、＂TPLS＂;在进化关系上可划分为两大类;不同植物类黄酮3′-羟化酶具有一个跨膜结构域、定位于内质网上,并有一段与细胞色素P450功能区相匹配的功能域;类黄酮3′-羟化酶属具转运肽的亲水性稳定分泌蛋白,其二级结构为α-β型,α-螺旋和无规卷曲为最主要的结构元件,延伸链和β-转角散布于整个结构。可为类黄酮3′-羟化酶基因的克隆和遗传操作提供理论参考。