长苞铁杉nrDNA ITS区假基因化拷贝的克隆及序列分析研究

编号 zgly0000520105

文献类型 期刊论文

文献题名 长苞铁杉nrDNA ITS区假基因化拷贝的克隆及序列分析研究

作者 阚显照  乔才元  朱国萍  杨福生 

作者单位 中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室  安徽师范大学生命科学学院生物大分子进化重点实验室 

母体文献 激光生物学报 

年卷期 2007,16(2)

页码 208-215

年份 2007 

分类号 Q349.55  Q949.66 

关键词 长苞铁杉  核rDNA  假基因  克隆  序列分析 

文摘内容 NrDNA作为一个重要的工具,在许多分类等级上被广泛地应用于系统发育的分析.以长苞铁杉(Nothotsuga longibracteata)为实验材料,通过nrDNA ITS区特异拷贝的克隆及假基因化分析,在序列水平上探讨假基因化的特征,进而探讨引起多拷贝基因家族假基因化的分子机制.实验结果表明：假基因化拷贝的序列长度为1 745 bp,比其它拷贝短11 bp～12 bp;GC含量明显偏低,特别是5.8 S区和ITS2区的GC含量分别比其它克隆低6.15 %～6.17 %和5.75 %～6.15 %;5.8 S区和ITS2区序列变异大,遗传距离(d)分别为0.0718＋0.0221和0.0691＋0.0178;在系统发育的分析中出现异常的长枝现象。