长苞铁杉nrDNA内转录间隔区及5．8S的二级结构分析研究

编号 zgly0000519361

文献类型 期刊论文

文献题名 长苞铁杉nrDNA内转录间隔区及5．8S的二级结构分析研究

作者 阚显照  乔才元  高卉  朱国萍 

作者单位 中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室  安徽师范大学生命科学学院生物大分子进化重点实验室  生物环境与生态安全安徽省高校重点实验室 

母体文献 激光生物学报 

年卷期 2007,16(3)

页码 327-333

年份 2007 

分类号 Q349.55  Q949.66 

关键词 二级结构  长苞铁杉  核rRNA  内转录间隔区  5．8  S  rRNA  假基因 

文摘内容 核糖体RNA及相邻区域的二级结构研究，作为一个重要的工具，已在一些分类等级上被应用于系统发育的分析。以长苞铁杉为实验材料，通过克隆、测序，利用最小自由能原理预测nrDNA内转录间隔区及5．8S转录本的二级结构，分析它们的结构特点，探讨假基因化拷贝与功能拷贝结构上的差异。分析结果表明：(1)ITS1区的二级结构主要由几个延展的发夹结构组成，配对的亚重复单位在松科植物特有的保守序列处有部分重叠，未配对的亚重复单位通常能自身折叠，保守序列的部分碱基出现在发夹结构的环中；(2)假基因化拷贝二级结构的自由能比正常拷贝高；(3)与正常拷贝的二级结构相比，假基因化拷贝在进化速率很低的5．8S功能区发生较大的变异，且在5．8S末端没有和26S连接配对。