小菊锌指蛋白基因cDNA全长克隆及表达分析

编号 zgly0000601196

文献类型 期刊论文

文献题名 小菊锌指蛋白基因cDNA全长克隆及表达分析

作者 赵飞  周波  赵楠  李玉花 

作者单位 东北林业大学花卉生物工程研究所  山东农业大学园艺科学与工程学院 

母体文献 生物技术通讯 

年卷期 2008,19(1)

页码 39-42

年份 2008 

分类号 Q78 

关键词 小菊  锌指蛋白  克隆  表达 

文摘内容 目的：克隆菊花耐盐碱相关锌指蛋白基因，并进行盐胁迫和品种间差异的表达分析。方法：从大量菊花资源中筛选出抗盐碱品系小菊‘阳光’，利用RT—PCR从经150mmol／L碳酸钠处理的小菊‘阳光’叶片中分离得到一个锌指蛋白cDNA全长克隆，用Northern杂交检测其在不同盐处理和不同品种小菊中的表达。结果：获得了全长794bp的基因CmSTZF(GenBank接受号为DQ864730)，编码区为170个氨基酸残基。Blast分析表明，CmSTZF含有AN1型锌指结构，序列模式为C-X2-C—X(9—12)-C-X(1-2)-C-X4-C-X2-H-X5-H-X-C，由Cys^110-Cys^113-Cys^131-His^134及Cys^124-Cys^126-Cys^142-His^140分别围绕锌离子与其他氨基酸共同组成2个锌指四面体结构；在第67～76及第94～104氨基酸残基序列间存在核定位信号。同源性比较发现，CmSTZF与水稻OsISAPI具有54％的同源性，而二者的锌指保守区相似性达100％。Cluster分析表明，小菊CmSTZF锌指蛋白与水稻的2种逆境反应蛋白亲缘关系最近，归属同一类逆境功能蛋白。在150mmol／L碳酸钠胁迫下，耐盐小菊‘阳光’锌指蛋白表达量明显高于非耐盐小菊‘神韵’，表明CmSTZF锌指蛋白基因在盐碱胁迫下起重要的调控作用。结论：克隆了小菊耐盐碱相关的锌指蛋白基因CmSTZF，其在耐盐小菊‘阳光’中的表达量高于非耐盐小菊‘神韵’，这为小菊锌指蛋白基因CmSTZF耐盐碱功能分析奠定了基础。