山竹子基因组DNA提取及SRAP反应体系优化

编号 zgly0000639990

文献类型 期刊论文

文献题名 山竹子基因组DNA提取及SRAP反应体系优化

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 邹明宏  郭凌飞  曾辉  杜丽清  陆超忠  罗炼芳  张汉周 

作者单位 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所  广西亚热带作物研究所 

母体文献 经济林研究 

年卷期 2009,27(3)

页码 38-41

年份 2009 

分类号 S795.9 

关键词 山竹子  DNA提取  SRAP  体系优化 

文摘内容 采用改良CTAB法提取山竹子基因组DNA,并以me1和em3正反向引物组合对山竹子进行了SRAP体系的优化。结果表明：使用CTAB free缓冲液进行前处理可去除大部分的杂质,获得的DNA纯度较高,OD260/OD280均在1.7~1.9之间,RNA消化彻底,DNA无明显降解,进行SRAP分析条带清晰,多态性好。在25μL反应体系中,5种主要成分的适宜浓度或用量分别是：Taq DNA聚合酶0.5 U,Mg2＋2.0 mmol.L-1,dNTPs 0.15~0.2 mmol.L-1,模板DNA 10~50 ng,引物0.6~0.8μmol.L-1。该体系适用于山竹子SRAP分析,进行遗传图谱构建、基因定位与克隆、比较基因组学、遗传多样性、cDNA指纹图谱等方面的研究。