结球甘蓝核基因组密码子使用偏爱性分析

编号 zgly0001456950

文献类型 期刊论文

文献题名 结球甘蓝核基因组密码子使用偏爱性分析

作者 仪登霞  杨丽梅  方智远  刘玉梅  庄木  张扬勇  刘基生  刘博  武剑  耿丽丽  张杰  张振贤 

作者单位 中国农业科学院蔬菜花卉研究所  中国农业大学农学与生物技术学院  中国农业科学院植物保护研究所 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2013年10期

年份 2013 

分类号 S635.1 

关键词 甘蓝  密码子用法  高频密码子  密码子偏爱性 

文摘内容 根据甘蓝测序结果,利用CodonW软件对结球甘蓝的48 000个蛋白质编码基因序列进行了分析,计算出同义密码子相对使用频率,确定了TCT、CCT、AGA、GTT、GCT、GAT等6个高频密码子。将甘蓝与大肠杆菌、拟南芥、棉花、水稻的密码子使用频率进行了比较,发现甘蓝密码子使用偏爱性与同为双子叶植物的拟南芥、棉花基本一致,而与大肠杆菌及单子叶植物水稻均具有较大差异。以甘蓝密码子用法分析结果为依据,对Bt cry1C抗虫基因进行了密码子的改造,得到了具有甘蓝密码子使用特点的cry1C基因序列,为甘蓝的转基因研究奠定了分子基础。