文心兰EST-SSR标记的开发及其在遗传多样性分析中的应用

编号 zgly0001529052

文献类型 期刊论文

文献题名 文心兰EST-SSR标记的开发及其在遗传多样性分析中的应用

作者 林榕燕  钟淮钦  黄敏玲  罗远华 

作者单位 福建省农业科学院作物研究所  福建省农业科学院花卉研究中心  福建省特色花卉工程技术研究中心 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2016年11期

年份 2016 

分类号 S682.31 

关键词 文心兰  EST-SSR  多态性  遗传多样性 

文摘内容 本研究基于NCBI数据库中文心兰的EST序列,对其EST-SSR标记进行分析,并设计了20对EST-SSR引物用于30个文心兰品种遗传多样性性分析研究。对3 183条文心兰EST序列进行搜索,共检索出274个SSR位点,检出率为8.61%。二核苷酸重复类型是文心兰EST-SSR的主要重复类型,占60.58%。通过PCR扩增检测到13对引物有扩增产物,其中10对引物有多态性,平均每对引物扩增到10个多态性条带,各引物的多态性比率分布为75.00%~100.00%,多态性信息含量变化范围为0.69~0.93。聚类分析发现30个文心兰品种间的遗传距离变化在0.04~0.58,且在遗传距离为0.39处可将30个文心兰品种分为7大聚类群。