柱花草EST-SSR标记的鉴定及应用

编号 zgly0001528890

文献类型 期刊论文

文献题名 柱花草EST-SSR标记的鉴定及应用

作者 贾庆麟  张瑞花  王文强  丁西朋  刘国道  白昌军 

作者单位 海南大学农学院  中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2016年05期

年份 2016 

分类号 S541.9 

关键词 柱花草  EST-SSR  有效性  多态性 

文摘内容 为获得有效的分子标记,并应用于柱花草的遗传学研究中。本研究基于柱花草转录组测序获得的36 558条EST序列,利用MISA和PRIMER 3.0软件进行EST-SSR标记开发,对所开发标记进行特征分析,最终获得柱花草新EST-SSR标记2 008对,然后随机合成523对SSR标记并对其有效性及应用效果进行评价。其中主要重复类型是二核苷酸、三核苷酸,分别占30.50%和50.33%,在二、三核苷酸中的优势重复类型分别为AG/CT,AAG/CTT。在随机合成的523对引物中,472对引物都有扩增产物,扩增效率达到90.25%,其中有多态性的引物179对,占可扩增引物的37.92%,具有较高的多态性。利用新EST-SSR标记分析表明55份F1单株均为真杂种,并能对F2群体单株进行基因型鉴定。本研究开发的新EST-SSR标记将为柱花草遗传图谱的构建、基因克隆、指纹图谱构建奠定基础。