基于SLAF-seq技术的葡萄种质遗传多样性分析

编号 zgly0001689407

文献类型 期刊论文

文献题名 基于SLAF-seq技术的葡萄种质遗传多样性分析

作者 李贝贝  张恒  姜建福  张颖  樊秀彩  房经贵  刘崇怀 

作者单位 中国农业科学院郑州果树研究所  南京农业大学园艺学院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2019年11期

年份 2019 

分类号 S663.1 

关键词 葡萄  SLAF-seq  SNP  遗传多样性 

文摘内容 利用简化基因组测序技术(SLAF-seq)对304份葡萄种质进行测序,最终获得466 618个SLAF标签,其中多态性SLAF标签392 374个。通过序列分析,获得481 192个有效单核苷酸(SNP)多态标记,并基于这些SNP分析和构建了304个葡萄种质的群体结构和系统发生树。结果表明,SLAF-seq技术能高效、低廉地开发出大量可用于群体遗传分析的SNP标记。通过构建进化树分析发现,欧亚种、欧美杂种及野生种葡萄彼此分开,其中姊妹系品种及具有亲子代关系的品种各自聚在一起,中国葡萄地方品种与国外古老葡萄品种的亲缘关系最近,且起源及遗传背景不详的古老葡萄品种与野生种的亲缘关系较改良品种更近。该结果可为后期进一步研究葡萄的起源进化提供参考,同时为构建SNP指纹数据库提供了基础数据。