基于Hurst指数的DNA序列相似性分析

编号 zgly0001394483

文献类型 期刊论文

文献题名 基于Hurst指数的DNA序列相似性分析

作者 刘晓  邹克琴  李素芳 

作者单位 重庆大学通信工程学院  中国计量学院生命科学学院 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2011年03期

年份 2011 

分类号 Q523 

关键词 Hurst指数  外显子  序列相似性 

文摘内容 【目的】建立直接将Hurst指数作为指标参数进行DNA序列相似性分析的方法。【方法】以11个物种β-球蛋白第一个外显子的编码序列作为分析对象,首先将DNA序列转化为数字序列,然后用重标极差分析法计算各编码序列的全序列Hurst指数,之后利用它们的Hurst指数构建距离矩阵进行相似性分析,并将建立的基于Hurst指数的DNA序列相似性分析方法与其他方法的分析结果进行比较。【结果】建立的基于Hurst指数的DNA序列相似性分析方法,较好地从相关性角度反映了分析序列的生物特性指标,具有较好的相似性分析效能。与其他方法相比,该方法分析结果的敏感性较高,有助于提高进化距离较近的分析对象间的区别度。【结论】Hurst指数可以作为指标参数描述DNA序列的相似性,可将其进一步应用于生物序列的信息分析。