旱柳与龙爪柳α微管蛋白基因家族的克隆与序列分析

编号 zgly0001529001

文献类型 期刊论文

文献题名 旱柳与龙爪柳α微管蛋白基因家族的克隆与序列分析

作者 睢金凯  饶国栋  张建国 

作者单位 国家林业局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所  南京林业大学南方现代林业协同创新中心 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2016年09期

年份 2016 

分类号 S792.12 

关键词 α微管蛋白  序列相似性  系统发育  q RT-PCR 

文摘内容 本研究以杨树和拟南芥α微管蛋白氨基酸序列为探针,利用本地化BLAST工具搜索柳树全基因组数据库,根据搜索所获序列克隆旱柳和龙爪柳α微管蛋白基因。通过q RT-PCR技术分析不同柳树组织中α微管蛋白基因的表达水平,并利用Bio Edit和MEGA5软件分别进行序列相似性和系统发育分析。结果显示,两种柳树各有8个α微管蛋白基因。柳树种内两两基因间核苷酸和氨基酸序列相似性分别在78.3%和88.4%以上,种间α微管蛋白氨基酸序列相似性在88.2%以上,而柳树与其它植物间的α微管蛋白氨基酸序列相似性在85.1%以上。我们还发现,半数α微管蛋白都包含一个C末端甲硫氨酸、亮氨酸、谷氨酸或谷氨酰胺,而不是更为典型的酪氨酸。在系统发育分析中α微管蛋白分为两类,说明这些基因可能起源于不同的祖先。C末端为Y型的TUA1基因在柳树一年生枝条基部、中段、伸长区和茎尖中高度表达,据此推测它们可能参与柳树木质部的发育过程。柳树TUA基因家族高度的序列相似性、C末端多样性和不同的表达模式可能赋予了细胞壁形成的灵活性,这对多年生木本植物的适应性具有重要意义。