铁皮石斛鲨烯合酶基因的克隆及其组织表达模式分析

编号 zgly0001461849

文献类型 期刊论文

文献题名 铁皮石斛鲨烯合酶基因的克隆及其组织表达模式分析

作者 张岗  唐志书  周莉英  刘清  李依民  张小飞  吕欣 

作者单位 陕西中医学院药学院/陕西省中药基础与新药研究重点实验室  西北农林科技大学食品科学与工程学院 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2013年09期

年份 2013 

分类号 S567.239 

关键词 铁皮石斛  鲨烯合酶  基因克隆  表达模式  结构域  萜类 

文摘内容 【目的】克隆珍稀濒危兰科药用植物铁皮石斛(Dendrobium officinale Kimura et Migo)鲨烯合酶(Squalene synthase,SS)基因(DoSS),并对其进行生物信息学与组织表达模式分析,为研究其生物学功能提供参考。【方法】采用RT-PCR和RACE技术,获得DoSS基因全长序列;利用生物信息学软件预测DoSS蛋白的理化性质、结构域及亚细胞定位等分子特性;用DNASTAR 6.0和MEGA 4.0分别进行DoSS蛋白氨基酸多序列比对和进化关系分析;借助qPCR检测DoSS基因的组织表达模式。【结果】成功克隆获得铁皮石斛鲨烯合酶基因,命名为DoSS(GenBank注册号JX272631),其cDNA全长1 735bp,编码一条由410个氨基酸组成的多肽,分子质量46.99ku,等电点7.13;DoSS蛋白含有鲨烯/八氢番茄红素合成酶保守结构域(44-315位氨基酸);DoSS与其他多种植物SS基因的编码蛋白同源性很高(61%~75%),与水稻、玉米等单子叶植物的亲缘关系较近;DoSS基因为组成型表达,在根中的表达量最大,为叶的12.41倍;茎次之,为叶的1.87倍。【结论】成功克隆得到1个鲨烯合酶基因(DoSS)全长cDNA;DoSS基因的(在根中高)表达特征暗示,其可能在铁皮石斛根的生长发育中发挥重要的调控功能。