Argonaute1敲除前后尖孢镰刀菌转录组分析比较

编号 zgly0001682281

文献类型 期刊论文

文献题名 Argonaute1敲除前后尖孢镰刀菌转录组分析比较

作者 梁丽琴  杜海燕  段江燕  谢丙炎 

作者单位 山西师范大学生命科学学院  中国农业科学院蔬菜花卉研究所农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室 

母体文献 植物病理学报 

年卷期 2019年05期

年份 2019 

分类号 S432.44 

关键词 转录组分析  尖孢镰刀菌  Argonaute1 

文摘内容 Argonaute蛋白(AGO)介导的沉默复合体在RNA干扰(RNAi)中起着至关重要的作用。为了探究AGO1在尖孢镰刀菌RNAi中的作用机制,本文以粘团专化型尖孢镰刀菌生理1号小种FOX-A8野生型和其AGO1缺失突变体(FOX-A8-△Ago1)的菌丝和孢子为材料,分别进行了RNA提取、Illumina Hi Seq 2000高通量转录组测序、差异表达基因(DEGs)的显著富集分析;选择菌丝和孢子中的DEGs进行实时荧光定量PCR(Quantitative real-time PCR,qRT-PCR)验证。GO通路注释结果显示,相对于野生型菌株,AGO1缺失突变体菌丝中的醇脱氢酶(NADP~+)、孢子中的CAMK/CAMKL/CHK 1蛋白激酶均显著上调; KEGG通路注释结果显示,相对于野生型菌株,AGO1缺失突变体菌丝中与MAPK信号通路相关的基因、孢子中与PLD信号通路相关的基因均显著下调;另外,相对于野生型菌株,编码AGO2的基因下调,但是下调不显著。qRT-PCR检测DEGs的表达模式与RNA-Seq分析结果一致,证实了RNA-Seq结果的可靠性。