丹参普遍胁迫蛋白基因(SmUSP)的克隆及表达模式分析

编号 zgly0001461744

文献类型 期刊论文

文献题名 丹参普遍胁迫蛋白基因(SmUSP)的克隆及表达模式分析

作者 邝静  生华  武玉翠  葛茜  张媛  王喆之 

作者单位 药用资源与天然药物化学教育部重点实验室  西北濒危药材资源开发国家工程实验室  陕西师范大学生命科学学院 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2013年04期

年份 2013 

分类号 S567.53 

关键词 SmUSP  生物信息学分析  表达模式分析 

文摘内容 通过BLAST比对分析丹参EST数据库,发现一个与普遍胁迫蛋白(USP)基因家族同源性较高的基因序列,命名为SmUSP,GenBank登录号为JX416284。依据该序列,从DNA和cDNA水平克隆得到该基因全长,经分析发现该基因无内含子序列,包含一个长711bp的完整开放读码框(ORF),编码236个氨基酸残基。生物信息学分析显示,SmUSP编码蛋白的相对分子量25.5kDa,为无信号肽和跨膜结构域的疏水酸性蛋白;SmUSP具有UspA结构域和ATP结合位点,属于USP蛋白UspFG亚家族。实时荧光定量PCR分析表明,SmUSP在丹参的根、茎、叶、花中均有表达,在根中的表达量较高。同时,SmUSP表达受茉莉酸甲酯(MeJA)、水杨酸(SA)、脱落酸(ABA)以及脱水胁迫的上调诱导,推测该基因可能在丹参防御反应中发挥作用。