磁珠富集法筛选方正银鲫的三、四核苷酸重复微卫星DNA

编号 zgly0000705995

文献类型 期刊论文

文献题名 磁珠富集法筛选方正银鲫的三、四核苷酸重复微卫星DNA

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 曹柱  鲁翠云  郑先虎  储志远  张天奇  赵元凤  孙效文 

作者单位 大连海洋大学生命科学与技术学院  中国水产科学研究院黑龙江水产研究所 

母体文献 淡水渔业 

年卷期 2011,41(1)

页码 22-28

年份 2011 

分类号 S917.4 Q954 

关键词 方正银鲫(Carassius  auratus  gibelio(Bloch))  微卫星  磁珠富集法 

文摘内容 通过生物素磁珠富集法开发方正银鲫(Carassius auratus gibelio(Bloch))三、四核苷酸重复的微卫星,并与传统的放射性同位素杂交法相结合,进行二次筛选微卫星分子标记。结果显示: 对652个阳性克隆进行测序分析,获得微卫星序列800个,其中完美型542个(67.75%),非完美型140个(17.50%),混合型118个(14.75%)。用引物设计软件primer3plus在线设计引物163对,选择合成76对,引物多态性通过二倍体野生鲫群体进行检测。检测结果显示,30对引物表现出不同程度多态性,等位基因数在3～8之间,多态信息含量(PIC)在0.4066～0.8023之间,其中80%为高度的多态性位点(PIC〉0.5),表明方正银鲫微卫星文库是个高质量的文库。