背角无齿蚌基因组(GT)_n微卫星DNA特征

编号 zgly0001394263

文献类型 期刊论文

文献题名 背角无齿蚌基因组(GT)_n微卫星DNA特征

作者 汪桂玲  苏翔  李家乐  白志毅 

作者单位 海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室  上海市高校水产养殖学E-研究院 

母体文献 生态学杂志 

年卷期 2011年01期

年份 2011 

分类号 S917.4 

关键词 背角无齿蚌  磁珠富集法  微卫星 

文摘内容 利用磁珠富集法筛选背角无齿蚌(Anodonta woodiana)的微卫星分子标记,采用Sau3A1酶对完整DNA进行酶切,以生物素标记的(GT)15寡核苷酸探针从酶切片段中筛选微卫星序列。洗脱的杂交片段克隆到PGEM-T载体上构建富集微卫星基因组文库后,通过菌液PCR筛选检测出阳性克隆进行测序。结果表明:在筛选的180个阳性菌落中,得到37条非冗余序列包含有重复次数不少于5次的微卫星位点,富集效率为20.6%,核心重复序列主要为两碱基重复,占所有微卫星序列的86.4%,其中完美型占32.0%,非完美型占10.0%,复合型占8.0%,非完美与复合型共存的占50.0%;其中完美类型微卫星最大的重复次数为65次;在37条非冗余序列中,共有30条微卫星重复序列两端有侧翼序列能够进行引物设计,经过筛选,11对引物扩增清晰的多态性条带,可用于无齿蚌遗传分析。