普通鸬鹚基因组微卫星分布规律研究

编号 zgly0001693625

文献类型 期刊论文

文献题名 普通鸬鹚基因组微卫星分布规律研究

作者 黄杰  刘磊  杨波  杨承忠 

作者单位 商丘师范学院生物与食品学院  中国大熊猫保护研究中心  重庆师范大学生命科学学院重庆市动物生物学重点实验室 

母体文献 野生动物学报 

年卷期 2020年01期

年份 2020 

分类号 Q953 

关键词 普通鸬鹚  微卫星  基因组  分布规律 

文摘内容 本研究对普通鸬鹚全基因组微卫星分布规律进行分析,结果表明:普通鸬鹚基因组中微卫星总个数为135 498个,总长度为2 304 711 bp。6种重复类型中,单碱基重复数量最多,为102 005个,占重复类型总数目的 75. 3%,其次是四、二、三、五、六碱基重复类型,分别占到总数的7. 8%、6. 9%、6. 5%、3. 0%、0. 5%。不同的拷贝类型在微卫星中重复拷贝类别数量有所差别,单碱基微卫星中A重复类型数量最多,所占比例为96. 67%,其次是二碱基中AC最多、三碱基AAT最多、四碱基AAAC最多,所占比例分别为55. 39%、30. 26%、30. 74%。在普通鸬鹚基因组中微卫星数量最多的前16种重复拷贝类别依次为A、AC、C、AAAC、AAT、AT、AAAT、AAC、AG、AGG、AAAG、AAGG、ACC、ACG、AACC、AGC。本研究为以后普通鸬鹚微卫星的筛选、遗传结构分析、个体识别、遗传多样性分析等方面奠定了基础。