基于简化基因组测序开发垂穗披碱草(Elymus nutans)SSR标记

编号 zgly0001634583

文献类型 期刊论文

文献题名 基于简化基因组测序开发垂穗披碱草(Elymus nutans)SSR标记

作者 刘瑞娟  路兴旺  窦全文 

作者单位 中国科学院西北高原生物研究所中国科学院高原生物适应与进化重点实验室  中国科学院大学  中国科学院西北高原生物研究所青海省作物分子育种重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年06期

年份 2018 

分类号 S543.9 

关键词 垂穗披碱草  SSR  简化基因组测序 

文摘内容 垂穗披碱草为青藏高原重要生态草及优质多年生牧草。本研究中,通过简化基因组测序技术筛选和鉴定得到了14个多态性的垂穗披碱草基因组SSR标记。14个SSR标记在24个不同垂穗披碱草个体中等位基因数变化范围为2~5,平均每个位点的等位基因数为2.9。近缘种扩增结果显示分别有14对和9对引物在老芒麦和鹅观草属物种中有目标产物扩增,表明14个SSR标记中5个可能是H基因组特异性标记,其余9个可能来自St组或Y组。这些新开发的SSR标记,今后可应用于垂穗披碱草及其近缘种的遗传多样性研究等领域。同时就利用简化基因组测序技术开发SSR标记的效率进行了讨论。