盐生植物海马齿SpCBL10基因的克隆及结构预测

编号 zgly0001478496

文献类型 期刊论文

文献题名 盐生植物海马齿SpCBL10基因的克隆及结构预测

作者 周扬  胡艳平  杨成龙  段瑞军  符少萍  胡新文  郭建春 

作者单位 中国热带农业科学院生物技术研究所  农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室  华中农业大学植物科学技术学院  海南大学 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2014年04期

年份 2014 

分类号 Q943.2 

关键词 海马齿  SpCBL10  基因克隆  结构预测 

文摘内容 本研究以盐生植物海马齿总RNA为模板,采用RT-PCR和RACE技术,获得海马齿SpCBL10基因。生物信息学分析表明:海马齿SpCBL10基因全长1 575bp,其中CDS序列长度为759 bp,编码252个氨基酸,含有4个典型的结合钙离子的结构域,即EF手臂;SpCBL10蛋白的理论分子量为28.92 kD,等电点为4.74,是一种亲水性的稳定蛋白;该基因编码的蛋白含有一个跨膜区;其蛋白质二级结构中,α-螺旋占52.38%,β-折叠占7.54%,无规则卷曲占32.54%;同源性比对发现它与拟南芥CBL家族中的AtCBL10的相似性最高,达到66.15%,推测其在功能上与AtCBL10类似。本研究结果可为进一步研究SpCBL10基因的功能以及研究海马齿耐盐SOS途径提供理论参考。