基于叶绿体DNA片段序列的臭柏种群遗传结构分析

编号 zgly0001577046

文献类型 期刊论文

文献题名 基于叶绿体DNA片段序列的臭柏种群遗传结构分析

作者 杜湜  郝蕾  王颖  张国盛  乌兰娜日  吴伟  曲娜  高达布希拉图 

作者单位 内蒙古农业大学林学院  内蒙古鄂尔多斯市乌审旗林业局  内蒙古毛乌素沙地柏自然保护区管理局  内蒙古自治区林业科学研究院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年01期

年份 2018 

分类号 Q943 

关键词 臭柏  单倍型  遗传结构 

文摘内容 本实验选取内蒙古自治区及其附近地区分布的臭柏9个野生种群(共221个个体)为材料,对其叶绿体DNA的非编码区序列trn L-trn F,trn S-trn G和trn D-trn T进行测序,通过分析叶绿体DNA序列变异来获得单倍型类型。发现序列总长度为2 068~2 073 bp,总共观察到了三处变异位点,将这三个变异位点组合后共获得了四个单倍型:H1、H2、H3和H4,其中H1单倍型分布最广。物种水平上单倍型多样性(Hd)指数为0.072,核苷酸多样性(π)指数为0.000 14;种群水平上Hd指数介于0~0.239,π指数介于0~0.000 63。种群间基因分化系数Gst为0.045、固定指数Fst为0.071。研究结果表明臭柏种群间遗传变异较低,种群内遗传变异较高。